Après des études de géologie, c’est au cours d’une formation en régie au Théâtre National de Strasbourg dirigé alors par Jean-Pierre Vincent que Françoise Michel découvre la lumière et la mise en scène. Plus tard, elle rencontre la danse avec Odile Duboc. Les notions de mouvements, de lignes, de formes lui parlent, et elle voit dans l’univers chorégraphique un terrain où la lumière peut s’écrire comme une mise en scène. C’est le début d’une longue collaboration sur la conception et la réalisation des spectacles qu’elles feront ensemble, au sein de la compagnie Contre Jour qu’elles fondent en 1983, puis au Centre Chorégraphique National de Franche-Comté à Belfort à partir de 1990 jusqu’en 2008.
En 1999, elle cosigne avec Odile Duboc la mise en scène de Thaïs de Massenet, en signe la lumière et pour la première fois, riche de ses multiples expériences, fait le choix d’en créer la scénographie. Elle signera par la suite le décor de Le Pupille veut être tuteur créé par Odile Duboc et sera à l’origine des scénographies de J’ai mis du sable exprès, vite fait, comme ça dans mes chaussures et du spectacle Rien ne laisse présager de l’état de l’eau.
Plus récemment (2009) elle crée la scénographie et la lumière de Music hall, texte de Jean-Luc Lagarce, mis en scène par Lambert Wilson avec Fanny Ardant, aux Bouffes du Nord.
Durant toutes ces années, elle a travaillé avec de nombreux chorégraphes, Georges Appaix, Josette Baiz, Ydeyuki Yano, Francine Lancelot, le groupe Dunes, Mark Tompkins, Daniel Larrieu, François Raffinot, Marceline Lartigue, Emmanuelle Huynh, Kader Attou, Daniel Dobbels, Emmanuelle Vo-Dinh, Mié Coquempot …
Françoise Michel n’abandonne pas pour autant l’aventure théâtrale et lyrique et travaille avec de nombreux metteurs en scène. François Chattot, Valère Novarina, Hélène Vincent, Denis Loubaton, Jean-Claude Berutti, Yoshi Oïda, Dagmar Pischel, François Berreur, Lambert Wilson …